RIRS के खर्च को कई कारक प्रभावित करते हैं, जिन्हें नीचे बताया गया है।
- मूत्र रोग विशेषज्ञ का अनुभव
 - यूरोलॉजिस्ट का परामर्श शुल्क
 - एनेस्थीसिया का खर्च
 - ऑपरेशन से पहले या बाद में आवश्यक दवाओं का खर्च
 - ऑपरेशन के लिए अस्पताल का विकल्प (निजी या सरकारी)
 - स्थिति की जटिलता
 - सर्जरी से पहले होने वाले परीक्षणों का खर्च
 - ऑपरेशन के बाद डॉक्टर से परामर्श का शुल्क